Однако, как сообщает Новый регион, сам Яковенко и многие члены Союза считают, что настоящей причиной стала политическая позиция главы организации.
В решении Федеративного совета Союза говорится, что Яковенко снят с должности за невыполнение решений VIII съезда - по созданию Центра развития СМИ, передает «Эхо Москвы». Яковенко обвиняют в том, что он использовал ресурсы Союза журналистов России в пользу частных компаний, в которых он выступал в качестве учредителя или соучредителя.
Вопрос о целесообразности нахождения Яковенко в руководстве Союза журналистов был поднят уже весной, уточняет NEWS.ru. Некоторые представители СЖР тогда заявляли, что политическая позиция Яковенко, его критические высказывания в адрес власти и тесное сотрудничество с оппозиционными организациями деструктивно действуют на Союз журналистов и мешают договариваться с властью.
Игорь Яковенко с 1998 года занимал пост генерального секретаря Союза журналистов, на восьмом съезде он был избран секретарем организации. Вместо Яковенко Союз возглавили телекритик «Эха Москвы» и газеты «Известия» Ирина Петровская и председатель ассоциации «Судебный репортер» и обозреватель «Новой газеты» Леонид Никитинский.