Прокуратурой НАО установлено, что по состоянию на 1 апреля 2009 года сумма задолженности перед членами окружных сельхозкооперативов (СПК) составила 5 миллионов рублей. Это выяснилось в ходе проверки, по результатам которой 5 мая прокурор округа вынес главе администрации Архангельской области Илье Михальчуку представление об устранении нарушений законодательства, так как органы государственной власти Архангельской области осуществляют полномочия по поддержке сельскохозяйственного производства на территории Ненецкого округа.
По мнению окружной прокуратуры, задолженность по кооперативным выплатам возникла в связи с тем, что в первом квартале 2009 года Департамент агропромышленного комплекса Архангельской области не перечислил субсидий на компенсацию расходов, связанных с осуществлением деятельности ненецких СПК.
В своём письме Уполномоченному заместитель главы администрации области по вопросам экономического развития и финансам Дмитрий Плетнёв пояснил, что в соответствии с Правилами предоставления субсидий государственная поддержка сельскохозяйственного производства осуществляется путем предоставления денежных средств на компенсацию части затрат на сельскохозяйственное производство. Использование субсидии на кооперативные выплаты членам СПК является нарушением законодательства. Кооперативные выплаты, в соответствии с федеральным законом «О сельскохозяйственной кооперации», должны производиться по итогам работы сельскохозяйственных производственных кооперативов за год, путем распределения части дохода кооператива.
По мнению Дмитрия Плетнёва, нет и нарушений порядка предоставления субсидий на поддержку сельскохозяйственных товаропроизводителей НАО. Так как по состоянию на 1 июня 2009 года расходы на осуществление этих полномочий профинансированы областью в сумме 89 с лишним миллионов рублей, что составляет более 88 процентов к плану на 1 полугодие и 45 с половиной процентов к годовой бюджетной росписи.